対処法などがあるわけではないのですが、現象が発生しているということで一応メモしておきます。
Vivaldi を 5.0.2497.32
にアップデートしたところ、 Chrome拡張機能 の Create Link (5.1、入れ直した5.5の2つとも) の挙動が不安定になりました。
権限の付与を実施したにも関わらず、右クリックから Create Link の項目で Plain, HTML, Markdown のいずれも選択時にコピーできたりできなかったりと、その時々で挙動が不安定な状態になってしまいました。
なお、 Vivaldi だけでなく Chrome でもダメなことが分かりました。こちらは 96.0.4664.110
(64bit) で確認しました。
おそらく Chrome のアップデートに伴う不具合だと思いますが……解消されるでしょうか。